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分子遺傳

 

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分子遺傳課題組成立于2001年,課題組以十字花科蔬菜作物基因組學(xué)與分子遺傳學(xué)研究為基礎(chǔ),以促進(jìn)蔬菜作物分子育種為目標(biāo),致力于利用基因組學(xué)工具解析蕓薹屬蔬菜葉球、膨大根/莖和抽薹開(kāi)花等關(guān)鍵性狀的形成、演化和馴化過(guò)程,以及基因組學(xué)在分子育種中的應(yīng)用研究。課題組于2011年領(lǐng)導(dǎo)完成了白菜基因組草圖的構(gòu)建,隨后參加完成了甘藍(lán)、黑芥和芥菜等參考基因組草圖的構(gòu)建;基于基因組重測(cè)序及泛基因組研究揭示了白菜和甘藍(lán)葉球馴化及物種豐富變異的機(jī)制等,在十字花科作物基因組研究領(lǐng)域居于國(guó)際領(lǐng)先地位。課題組搭建和維護(hù)著全球最重要的十字花科植物數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站BRAD(brassicadb.cn),為國(guó)際十字花科植物相關(guān)研究提供數(shù)據(jù)支持。課題組還建立了高通量智能基因分型平臺(tái),顯著提高了分子育種的自動(dòng)化水平。課題組先后承擔(dān)了“973”、“863”、國(guó)家自然基金重點(diǎn)項(xiàng)目、十四五重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃等一系列重大項(xiàng)目和課題。迄今在Nature Genetics、 Nature Plant、Nature Communications、 PNAS、 Genome Biology 和Plant Cell等國(guó)際知名刊物上發(fā)表SCI論文150余篇。


部分在研項(xiàng)目:

1. 十四五重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目:番茄、白菜等主要蔬菜高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)性狀形成的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò), 2022.12-2027.11

2. 十四五重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃課題:經(jīng)濟(jì)作物種質(zhì)資源全景多維組學(xué)剖,2021.12-2026.11

3. 國(guó)家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目:白菜葉球形成的遺傳解析與亞種間雜種優(yōu)勢(shì)的應(yīng)用,2017.1-2021.12

4. 國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目:蕓薹屬蔬菜作物綠體春化的分子遺傳機(jī)制解析,2021.1-2024.12

5. 國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目:BrBRX.2基因在大白菜葉球形成中的功能及作用機(jī)理,2021.1-2024.12

6. 國(guó)家自然科學(xué)基金青年基金項(xiàng)目:轉(zhuǎn)座子插入變異對(duì)大白菜葉球性狀形成的作用規(guī)律, 2024.1- 2026.12

7. 國(guó)家特色蔬菜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系:2017.1-2025.12


代表性論文:

1. Subgenome parallel selection is associated with morphotype diversification and convergent crop domestication in Brassica rapa and Brassica oleracea. Nature Genetics, 2016. 48:1218-24.

2. The genome of the mesopolyploid crop species Brassica rapa. Nature Genetics, 2011. 43(10): 1035-9.

3. The genome sequence of allopolyploid Brassica juncea and analysis of differential homoeolog gene expression influencing selection. Nature Genetics, 2016. 48:1225-32.

4. Gene retention, fractionation and subgenome differences in polyploid plants. Nature Plants, 2018. 4(5):258-268.

5. Origin, inheritance, and gene regulatory consequences of genome dominance in polyploids. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2014. 8;111(14):5283-8.

6. Deciphering the diploid ancestral genome of the Mesohexaploid Brassica rapa. Plant Cell, 2013. 25(5) :1541-1554.

7. Impacts of allopolyploidization and structural variation on intraspecific diversification in Brassica rapa. Genome Biology, 2021. 22, 166.

8. BRAD V3.0: an upgraded Brassicaceae database. Nucleic Acids Research, 2022. 7;50(D1): D1432-D1441.


主要獲獎(jiǎng):

1. 甘藍(lán)雄性不育系育種技術(shù)體系的建立與新品種選育,國(guó)家科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎(jiǎng)二等獎(jiǎng),2014

2. 白菜基因組測(cè)序和功能研究,中國(guó)園藝學(xué)會(huì),華耐園藝科技獎(jiǎng),2014

3. 十字花科蔬菜基因組信息解析與重要性狀遺傳基礎(chǔ),浙江省自然科學(xué)一等獎(jiǎng),2019

4. 十字花科蔬菜基因組演化與重要園藝性狀馴化,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院,青年科技創(chuàng)新獎(jiǎng),2020

5. 白菜類作物開(kāi)花時(shí)間的分子遺傳分析, 河北省自然科學(xué)獎(jiǎng)二等獎(jiǎng),2015

 

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