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溫室白粉虱染色體水平基因組研究揭示其抗藥性分子機制

    我所蔬菜蟲害防控創(chuàng)新團隊和美國康奈爾大學(xué)BTI合作解析了世界重大農(nóng)業(yè)害蟲溫室白粉虱基因組,揭示了其發(fā)育特異性表達和抗藥性分子機制,相關(guān)研究于3月27日在線發(fā)表于《Molecular Ecology Resource》上。
    溫室白粉虱(Trialeurodes vaporariorum, n=11)和煙粉虱是世界上分布最廣且危害最為嚴(yán)重的兩種粉虱類害蟲。煙粉虱基因組早在16年和17年由合作雙方共同解析完成,但溫室白粉虱基因組一直懸而未決。本研究中,利用三代測序平臺Pacbio長reads和Hi-C技術(shù),實現(xiàn)了白粉虱基因組染色體級別的組裝。結(jié)果發(fā)現(xiàn)白粉虱基因組組裝大小為787Mb,含11條染色體級別scaffolds(scaffold N50長達70Mb);注釋到18,275個蛋白編碼基因,重復(fù)序列占基因組的56.6%;白粉虱發(fā)育階段特異性表達分析找到一些和白粉虱蛹化和羽化有關(guān)聯(lián)的基因,例如卵黃蛋白基因和cuticle基因;白粉虱和煙粉虱進化上的分化程度遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于煙粉虱不同生物型之間;白粉虱和煙粉虱的比較基因組發(fā)現(xiàn),天冬氨酰蛋白酶家族在白粉虱中有顯著擴張,這可能和白粉虱所特有的寄主偏好有關(guān);通過細(xì)胞色素P450家族的比較分析,在白粉虱找到和煙粉虱CYPCM1同源的四個P450基因,這4個基因有可能幫助到白粉虱代謝新煙堿類藥劑。
    蔬菜蟲害防控創(chuàng)新團隊是以重大蔬菜害蟲的發(fā)生危害規(guī)律、災(zāi)變機制及其綠色防控技術(shù)的研發(fā)與應(yīng)用為研究方向,以蔬菜上入侵害蟲的入侵?jǐn)U散機制、重大抗性害蟲的抗性分子機理、開發(fā)新成災(zāi)害蟲的綠色防控技術(shù)為重點任務(wù)。溫室白粉虱基因組的解析對深入開展白粉虱功能基因組學(xué)研究、植物-昆蟲-微生物及病毒互作、粉虱類害蟲抗性治理應(yīng)用均具有重要意義。
    該研究是兩個團隊聯(lián)合協(xié)作取得的成果,謝文副研究員是第一作者,蔬菜蟲害防控創(chuàng)新團隊首席張友軍研究員和美國康奈爾大學(xué)BTI研究所Zhangyou Fei教授是本論文的共同通訊作者。
    論文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/1755-0998.13159

 

 

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